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同源染色體是在二倍體生物細胞中,形態、結構基本相同的染色體,並在減數第一次分裂的四分體時期中彼此聯會(若是三倍體及其他奇數倍體生物細胞,聯會時會發生紊亂),最後分開到不同的生殖細胞(即精子、卵細胞)的一對染色體,在這一對染色體中一個來自母方,另一個來自父方。
而在同源染色體中,通常不談x y染色體,X Y染色體主要為部分同源的染色體。在嚴格定義下,同源染色體主要是在一對的染色體中,有同樣的大小,形狀,基因座,在此XY染色體則為不同大小和形狀,所以有些書本中,不予認為是同源染色體。
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